1945年9月，根據(jù)中共中央指示，新四軍長江以南的部隊全部北撤蘇北地區(qū)，華中軍區(qū)、蘇皖邊區(qū)政府成立后，華中軍區(qū)衛(wèi)生部亦在淮安城（今淮安區(qū)）成立。11月，為整合原江南地區(qū)、蘇皖地區(qū)的新四軍醫(yī)療資源，華中軍區(qū)衛(wèi)生部著手于毗鄰大運河的湖心寺組建華中軍區(qū)第一后方醫(yī)院，作為華中軍區(qū)直屬總醫(yī)院，主要依托原蘇浙軍區(qū)衛(wèi)生部野戰(zhàn)醫(yī)院、后方醫(yī)院、蘇浙軍區(qū)一分區(qū)衛(wèi)生部等。

醫(yī)院初建時，職工達(dá)1200多人，收治任務(wù)為約1500名重傷病員，實際住院者常超過2000人。他們都是各地區(qū)轉(zhuǎn)來、當(dāng)?shù)責(zé)o法治療的危重傷病員�；�于兩淮地區(qū)是華中首府，而華中軍區(qū)第一后方醫(yī)院的規(guī)模與條件也頗為合適，因此宋慶齡女士打算以華中軍區(qū)第一后方醫(yī)院為基礎(chǔ)，將蘇北國際和平醫(yī)院設(shè)在淮安。宋慶齡在1946年初先后3次派國際友好人士嚴(yán)斐德赴湖心寺實地考察，了解實際情況。

宋慶齡收到嚴(yán)斐德的報告后，決定依托華中軍區(qū)第一后方醫(yī)院，按照其他國際和平醫(yī)院標(biāo)準(zhǔn)，進(jìn)行醫(yī)療器械和藥物等方面的捐助。華中軍區(qū)將第一后方醫(yī)院改名為蘇北國際和平醫(yī)院。對外，由華中軍區(qū)衛(wèi)生部部長齊仲桓兼任院長、副部長李振湘兼任副院長，住院總醫(yī)師由原華中第一后方醫(yī)院院長陳海峰兼任。

宋慶齡按照美國陸軍醫(yī)院的規(guī)模，為醫(yī)院配備250張床標(biāo)準(zhǔn)的全套裝備，用700多條大小船只，分批從上海經(jīng)鎮(zhèn)江、揚州、江都、邵伯，沿運河運送到湖心寺。全套骨科手術(shù)器械和骨科專用特制床、X光機、顯微鏡、冰箱，以及蒸餾器、消毒器、大量換藥用具和X光膠片，甚至連病歷紙和常用的護(hù)理用具等，也都有配備，幾乎是野戰(zhàn)醫(yī)院所需的全部物資。

蘇北國際和平醫(yī)院成立伊始，國民黨軍隊便對蘇皖解放區(qū)進(jìn)行了重點進(jìn)攻，醫(yī)院也更多地?fù)?dān)負(fù)起戰(zhàn)時醫(yī)療的任務(wù)。1946年7至8月，醫(yī)院收治蘇中戰(zhàn)役重傷病員1607人，9月收治兩淮保衛(wèi)戰(zhàn)傷病員1415人。9月22日，國民黨軍隊侵占淮安，蘇北國際和平醫(yī)院在河下鎮(zhèn)的一批傷員，由陳海峰率領(lǐng)從河下東街撤出，先轉(zhuǎn)移至淮安縣的蘇家嘴，再轉(zhuǎn)至沭陽縣的壙溝、周集一帶繼續(xù)治療。此后，又收治了大批宿北戰(zhàn)役中的傷病員。在北撤轉(zhuǎn)移山東后，蘇北國際和平醫(yī)院的名稱雖已不再使用，但依然發(fā)揮著重大作用，先后收治了萊蕪戰(zhàn)役、孟良崮戰(zhàn)役、諸城戰(zhàn)役中的傷病員5000余人。